Для следующего удобства создадим папку, нажав внизу окна со слоями на кнопку . Выделим все слои и переместим их в эту папку. Не забывайте, на шкале анимации тоже должны быть выделены все кадры!
Теперь можно закрыть созданную папку и куча слоев не будет мешаться.
Так же все кадры на шкале должны быть выделены, не забывайте об этом. В итоге у меня получилось две папки - с колором и с кадрами анимации. После добавления колора анимацию можно сохранить ( скриншот)